临床 Python 进阶路线图
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资料索引

精选的、经过验证的临床统计编程学习资源。 不做"链接大全" —— 每条都写明为什么值得看、什么时候用。


五份索引

文件 内容 什么时候看
01-GitHub权威仓库 CDISC / PHUSE / Atorus 等组织的核心开源仓库(含实测星标数) 想找现成的工具、想看别人怎么写生产代码时
02-标准与规范-CDisc-PHUSE CDISC 标准、受控术语、试点数据集、PHUSE 工作组 查口径、查定义、查合法取值时(最常用)
03-论文与技术资料 会议论文去哪找、怎么搜、该读哪些主题 遇到具体技术问题、想了解行业实践时
04-Python学习资源与工具链 官方文档、开发环境、包管理、8 周学习路径 刚开始学、或卡在某个工具上时
05-Agent开发与LLM资料 Agent 工程化、评估与测试、临床/受监管场景的 AI 官方材料 ★ 学完第 18–24 章,要把 Agent 用到真实项目时

如果你只有 10 分钟

按这个顺序打开 3 个链接:

  1. 🟢 CDISC 试点项目数据 —— 本项目全部案例的数据来源。唯一被 FDA 审阅过的公开完整数据集。 它可以让你在不接触真实患者数据的前提下,走完 SDTM → ADaM → TFL 的全流程。

  2. 🟢 PHUSE OSTCDA —— Open Source Technology in Clinical Data Analysis。 用 SAS / R / Python 实现同一张表并比对结果。 这是"用 Python 做临床统计到底靠不靠谱"最权威的回答。

  3. 🟢 CDISC CORE 规则引擎 —— 官方开源的合规性校验引擎(Python 实现)。 想理解"CDISC 合规到底在检查什么",直接读它的规则集最快。


一条学习建议

这个行业的知识有个特点:标准是公开的,实践是口口相传的。

  • 标准(SDTM/ADaM 的变量定义、CT 取值)→ 去 CDISC 官方 查原文,不要靠记忆。
  • 实践(这张表该用哪个分母、这个缺失值怎么补)→ 去 PHUSE 的工作组交付物与 PharmaSUG 论文里找共识, 但最终以你项目的 SAP 和公司 SOP 为准。
  • 代码(具体怎么写)→ 去看 phuse-org/phuse-scripts 和 atorus-research 的仓库。

三者不可互相替代。把"标准要求的"、"行业惯例的"、"你项目规定的"分清楚, 是临床统计程序员最重要的能力之一。


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